一、實驗原理

短串聯(lián)重復(Short tandem repeats, STR)，又稱微衛(wèi)星DNA(Microsatellite DNA)或簡單重復序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR)，是廣泛存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復序列。有絲分裂過程中DNA鏈之間的錯配引起的復制滑動被認為是導致STR產(chǎn)生的較為常見原因，并且依據(jù)不同復制單元大小的不同以及不同物種之間，復制滑動發(fā)生的概率也不相同。

STR是以核心序列(core repeat units)首尾相連多次重復形成。每個STR的核心序列結(jié)構(gòu)相同，長度為2-6bp，但其重復單位數(shù)目和重復區(qū)域的長度不同，因此STR在不同種族、不同人群之間的分布具有差異性，構(gòu)成了STR遺傳多態(tài)性。不同個體之間在一個同源STR位點的重復次數(shù)也不同，因而同指紋識別一樣，STR位點分析也可對個體進行身份識別。通過識別個體基因組在特定位點的特定序列重復，即可創(chuàng)建其基因檔案?；诖?，STR分析法已經(jīng)成為一種重要的鑒定分析方法，應用于法醫(yī)學、親子鑒定及細胞鑒定等領域。

二、應用簡介

細胞系因其具有無限傳代增殖、體外培養(yǎng)、培養(yǎng)條件簡單等原因，如今已被廣泛的應用于各類疾病的研究中。

三、實驗方法 

四、樣本送檢要求

1. 細胞懸液（細胞數(shù)≥106 個）-提供細胞，請用PBS懸浮細胞離心后，去上清液，將細胞沉淀加冰袋運輸。

2. 基因組DNA（≥20μL，濃度≥50ng/μL）-  提供DNA樣本時請加冰袋運輸；同時請注明DNA含量。

3. 僅對ATCC和DSMZ數(shù)據(jù)庫現(xiàn)有STR圖譜數(shù)據(jù)的細胞系進行品系鑒定。

4. STR鑒定樣本為均人源細胞，檢測21個基因位點。 

五、案例展示

六、常見問題

1、如何知道細胞系是否發(fā)生交叉污染了

如果存在細胞系之間發(fā)生交叉污染，而且鑒定用的細胞可能有兩種以上的細胞系時，那么在進行STR位點檢測的時候，多個位點會出現(xiàn)兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度，理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關系。因此，存在交叉污染的混合細胞系中，其中一個位點中某些峰會明顯高于其他的峰，其中大峰是屬于混合細胞系中那個主要細胞系，而小峰則屬于那個次要細胞系。

值得注意的是，當發(fā)生兩個或以上細胞混合的時候，檢測結(jié)果看起來非常像細胞系的“遺傳不穩(wěn)定”——當一個細胞系存在亞群時，尤其是一些癌細胞系， 由于遺傳不穩(wěn)定的存在，在一些位點的STR特性會不同。因此經(jīng)驗豐富的分子專家是非常重要的，他能夠幫助分析復雜的電泳圖譜（STR峰圖），從而判斷是否由于發(fā)生細胞系交叉污染而導致多等位基因情況。

2、如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細胞系的身份

收到細胞系鑒定結(jié)果以及STR信息，可以與參考數(shù)據(jù)庫進行比對。如果細胞樣本的每個STR位點和參考細胞STR位點都能重合匹配，即說明該細胞系正確，反之則說明你的細胞系可能被錯誤標記，交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來，匹配度≥80%即可認為該細胞系正確，匹配度＜80%則說明該細胞系的來源需要被懷疑。

如果細胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯誤標記，則需要拿更早代數(shù)的細胞進行鑒定，從而找到問題的起源或者直接從可靠的機構(gòu)購買一株新的細胞系。

3、如果細胞系沒有在數(shù)據(jù)庫中比對出結(jié)果怎么辦？

如果已知數(shù)據(jù)庫中沒有找到你的細胞信息，你可以用自己的細胞遺傳信息建立自己的遺傳特性，以便后期進行自己細胞庫的比對。

4、為什么報告內(nèi)最終結(jié)論，會出現(xiàn)匹配不上任何已知數(shù)據(jù)情況？

最大的可能性是因為這株細胞的標準序列并沒有收錄在國際的細胞庫之中，導致送檢樣本與任何的序列都不匹。出現(xiàn)這種情況大多數(shù)是因為該細胞系，可能是由國內(nèi)課題組自主建系的。

七、服務流程